今日は何の日！？2015年6月22日はエヴァンゲリオンで使徒が襲来する日だった！

西暦2015年。主人公は14歳の少年、碇シンジ。
彼が長いこと離れて暮らしていた父親に呼び出され、第３新東京市を訪れるところから話は始まる。

第3新東京市に上京した主人公・碇シンジは、葛城ミサトと待ち合わせるために公衆電話の前に立っていた。
ミサトはシンジの居場所を見失って車で街を翻弄する。
そのとき、シンジの目の前に現れたのは、巨大な人型の移動物体だった。